報告地點:未來技術學院學術報告廳(誠D100)
報告時間: 2023年11月23日15:00-16:00
主辦單位:未來技術學院海峽聯合研究院農業人工智能研究中心
報告題目:基于小鼠和人類腎臟單細胞表達圖譜的腎臟疾病狀態研究
報告人:周劍夫
簡介:
周劍夫,美國達特茅斯學院計算機科學博士、賓夕法尼亞大學醫學院博士后。在南開大學獲得學士和碩士學位。曾任美國Flagship VL56, Inc.公司(現Generate Biomedicines, Inc.公司)顧問。主要研究方向為生物信息學。長期從事單細胞分析和蛋白質設計方面的研究。
小鼠模型被廣泛用于研究腎臟疾病的發病機理,并在藥物發現中扮演著重要角色。然而,這些模型尚未經過系統性的分析和比較。為此,我們分析了來自18種常用的小鼠腎臟病模型的單細胞RNA測序數據(36個樣本),并且比較了患有糖尿病腎病的患者與小鼠的單核RNA測序數據。我們發現,雖然單細胞層面的基因表達變化大多具有模型特異性,但是不同的小鼠模型在通路層面上卻呈現出相似的變化。我們還觀察到,雖然患有糖尿病腎病的患者和小鼠只共享了少量具有細胞類型特異性的差異表達基因,但是,在通路層面的變化上,二者卻存在著許多顯著的相似之處。這項研究為腎臟病領域提供了一個全方位的小鼠腎臟單細胞圖譜,并且揭示了小鼠腎臟在不同疾病狀態下基因表達的共同點和差異。該研究結果更是突顯了動物模型和患者之間在單細胞基因表達變化上的有限重疊,以及二者在通路層面的一致變化。
